醫學院

• 醫學系
• 生物醫學研究所
  碩士班｜博士班
• 醫學檢驗生物技術學系
  碩士班
• 生物醫學影像暨放射科學學系
  碩士班
• 臨床醫學研究所
  碩士班｜博士班
• 基礎醫學研究所
  碩士班｜博士班
• 免疫學研究所
• 國際生物醫學碩士學位學程
• 老化醫學博士學位學程
• 轉譯醫學博士學位學程
• 癌症生物與藥物研發博士學位學程

牙醫學院

• 牙醫學系
  碩士班

中醫學院

• 中西醫結合研究所
  碩士班 | 博士班
• 中醫學系
  大學部甲組 | 大學部乙組
  碩士班
  分子醫學組 | 臨床醫學組 | 醫工材料組 | 醫史文獻組
  博士班
  分子醫學組 | 臨床醫學組 | 醫工材料組 | 醫史文獻組
• 針灸研究所
  碩士班 | 博士班
• 國際針灸碩士學位學程
• 學士後中醫學系
• 中獸醫碩士學位學程
• 中國藥學暨中藥資源學系
  碩士班｜博士班

藥學院

• 藥學系
  碩士班｜博士班
• 生技製藥產業博士學位學程

公衛學院

• 公共衛生學系
  碩士班｜博士班
• 醫務管理學系暨碩士班
  碩士班｜碩士在職專班
• 職業安全與衛生學系
  碩士班
• 健康風險管理學系
• 公共衛生國際碩士學位學程

健康照護學院

• 護理學系
  碩士班
• 物理治療學系
  碩士班
• 運動醫學系
• 二年制呼吸治療學系
• 呼吸治療學系
• 生物醫學工程碩士學位學程

生技製藥暨食品科學院

• 藥用化妝品學系
  碩士班
• 營養學系
  碩士班｜博士班
• 生物科技學系
  碩士班｜博士班
• 製藥碩士學位學程